1995.06    자연과학종합연구원 설립 - 초대 원장 "민영기 교수(우주과학과)" 취임

1995.09    개소식 및 현판식

1995.12    자연과학논문집 창간

1996.05    창립기념 심포지움 개최

1997.03    2대 원장 "최희찬 교수(응용수학과)" 취임

1998.09    제1회 국제 환경 심포지움 개최

1999.08    천체, 화학 국제 학술대회 개최

2001.03    3대 원장 "최석호 교수(응용물리학과)" 취임

2001.10    학술진흥재단 중점연구소 지정

2002.05    'Advanced Materials for Information Technology & Application 2002' 국제 워크샵 개최

2002.11    경기도 지역협력센타 (KRRC) 유치

2003.11    제5회 21세기  Frontier Science & Technology : 유기광전자소재 및 응용 심포지움 개최

2004.03    'The 2nd International Workshop on Advanced Materials for Information Technology & Applications 2004(IWAMITA 2004)' 개최

2005.07    제7회 "전자정보 신소재 및 응용기술" 심포지엄

2006.05    'The 3rd International Workshop on Advanced Materials for Information Technology & Applications 2006(IWAMITA 2006)' 개최

2007.03    과학 영재 교육 업무협력 조인식

2007.12    'The 4th International Workshop on Advanced Materials for Information Technology & Applications 2007(IWAMITA 2007)' 개최

2008.01    제11회 "전자정보 신소재 및 응용기술" 심포지엄

2008.05    제11회 "전자정보 신소재 및 응용기술" 심포지엄

2008.11    제12회 "전자정보 신소재 및 응용기술" 심포지엄

2009.05    제13회 "전자정보 신소재 및 응용기술" 심포지엄

2011.03    4대 원장 "안광현 교수(응용화학과)" 취임

2014.04    5대 원장 "김병학 교수(응용수학과)" 취임

2014.09    'The 6th East-Asian numerical astrophysics meeting' 개최

2014.11    공군사관학교 항공우주연구소와 MOU 체결

2015.06    서울대학교 수학연구소와 협약 체결

2016.01    단국대학교 기초과학연구소와 MOU 체결

2016.03    6대 원장 "이동훈 교수(우주과학과)" 취임

2017.03    7대 원장 "이호선 교수(응용물리학과)" 취임